当员工因工受伤导致残疾时，根据相关法律法规，雇主需承担相应的赔偿责任。这包括但不限于医疗费用、康复费用、误工费以及可能的伤残补助金等。此外，还应考虑工伤保险的相关规定，以确保员工权益得到充分保障。

关于加班工资的计算标准，根据现行劳动法律法规的规定，用人单位安排劳动者延长工作时间、休息日工作以及法定节假日工作的，应当支付相应的加班工资。具体的计算方法依据加班的时间段不同而有所区别。

工伤鉴定费用的承担问题有明确法律规定。根据相关法律法规，职工因工受伤后进行劳动能力鉴定时产生的费用，原则上由用人单位先行垫付；若鉴定结果为工伤，则该费用最终由工伤保险基金支付；如不属于工伤，则由申请鉴定的个人或单位承担。

关于请假是否影响年终奖的问题，主要取决于用人单位的具体规定以及劳动合同中的相关约定。一般而言，国家法律并未直接规定请假与年终奖之间的关系，但《中华人民共和国劳动法》等相关法律法规对劳动者权益保护有明确规定，任何扣除或减少年终奖的行为都必须符合法律规定，并且不得违反公平原则。

工伤保险与商业保险在性质、目的、适用范围及赔偿标准等方面存在显著差异。工伤保险是国家强制实施的一种社会保险制度，旨在保障因工作遭受事故伤害或患职业病的职工获得医疗救治和经济补偿；而商业保险则基于投保人自愿原则，通过签订保险合同来分散风险。